

Das Jahr 2262Den Völkern der Galaxis eröffnen sich neue, nie geahnte Chancen: Schatten und Vorlonen, die sie Jahrmillionen lang in Kriege verzettelten und in ihre Evolution pfuschten, sind vertrieben. Das tiefe Zerwürfnis in der Gesellschaft der Minbari wurde repariert, die Erde wurde mit vereinten Kräften von der Tyrannei Präsident Clarks befreit und alle wichtigen Völker der Galaxis haben sich zu einer neuen Interstellaren Allianz, die wissenschaftlichen Austausch, den Handel und den Frieden fördern soll, zusammengeschlossen.
Babylon 5 wird von Captain Lochley, einer von John Sheridan speziell für diesen Posten angeforderten Frau, übernommen. Michael Garibaldi, kurz darauf Chef des Geheimdienstes der Interstellaren Allianz, ist ihr gegenüber von Beginn an mißtrauisch; er hat guten Grund zu vermuten, sie habe im Bürgerkrieg auf der "falschen" Seite gestanden. Schließlich findet er heraus, daß Sheridan und Lochley vor vielen Jahren für kurze Zeit verheiratet waren. Sheridan hatte sie demnach ausgewählt, weil er weiß, daß er ihr in Notlagen stets wird vertrauen können.
Desweiteren gewährt Sheridan einer Gruppe von Telepathen unter der Führung von Byron Asyl auf Babylon 5. Byron findet durch Lyta Alexander, die zu seiner Geliebten wird, bald heraus, daß die Vorlonen die Telepathen als Kanonenfutter für ihren Krieg gegen die Schatten erschufen. Er fordert daher eine eigene Heimatwelt für Telepathen als Reparation. Seine Anhänger spalten sich jedoch und beginnen Terrorakte gegen die Station und das Personal; die Lage gerät außer Kontrolle. Bester kommt auf Captain Lochleys Bitte hin mit seinen Bluthunden nach Babylon 5, um die Abtrünnigen zu verhaften. Der Versuch endet mit einem Feuergefecht, in dem Byron und der kriminelle Teil seiner Anhänger verbrennen, während Rest unbehelligt abreisen darf. Lyta will sich fortan um Byrons Sache kümmern.
Im kaiserlichen Palast auf Centauri Prime gehen inzwischen seltsame Dinge vor; man trachtet dort und auf der Station nach Londos Leben, weswegen ihm G'Kar als Leibwächter zur Seite gestellt wird. Dem Großteil der Regierung, einschließlich Londo, unbekannt, greifen derweil Kriegsschiffe der Centauri-Republik Frachtschiffe der Völker der Interstellaren Allianz an. Dies treibt die Allianz beinahe zur Spaltung, weil niemand weiß, daß die Centauri verantwortlich sind und jeder den anderen beschuldigt. Nur der Regent scheint zu wissen, was vor sich geht. Garibaldi muß derweil feststellen, daß Bester ihm während seiner Gefangenschaft eine neurale Sperre eingepflanzt hat, die es ihm unmöglich macht, sich an ihm zu rächen. Aus Verzweiflung wendet er sich wieder dem Alkohol zu, was seine Arbeit bald wesentlich zu beeinträchtigen beginnt.
Lennier entdeckt Beweise, daß die Centauri-Republik die Schuld an den Angriffen auf die Frachter trägt; die centaurische Regierung leugnet, und bald kommt es zum Austritt der Centauri aus der Allianz. Ein Plan Sheridans, einen bewaffneten Konflikt zu vermeiden, schlägt fehl, und es kommt zum Krieg. Gegen Sheridans ausdrücklichen Befehl greifen Narn und Drazi am Ende Centauri Prime selbst an und legen die Hauptstadt in Schutt und Asche. Londo erfährt, daß der Krieg insgeheim von den Drakh, einem Dienervolk der Schatten, angezettelt wurde. Sie wollen nun die geschlagenen, haßerfülten Centauri führen, formen, manipulieren und sich dauerhaft auf Centauri Prime einrichten. Londo wird gezwungen, sich zum Imperator krönen und einen Wächter, durch den die Drakh seine Handlungen überwachen werden, einpflanzen zu lassen.
Mit Lochleys und Lises Hilfe überwindet Garibaldi seine Trinksucht und beschließt, mit Lise auf den Mars zu ziehen und sie zu heiraten. Zuvor schließt er aber mit Lyta, die inzwischen Terroranschläge auf das PSI-Corps organisiert, einen Handel: Er wird binnen zwei Jahren Geld für eine Vernichtung des Corps für sie auftreiben und verstecken, sie ihm nach Ablauf dieser Zeit die neurale Sperre entfernen, damit er sich an Bester rächen kann. Lyta und G'Kar, der nach der unvorhergesehenen Veröffentlichung seines Buches von Jüngern und Anhängern geradezu überschwemmt wurde und nun zu seinem eigenen und dem Wohle der Station gehen will, kaufen sich ein Forschungsschiff und gehen auf eine Entdeckungsreise durch das All. Dr. Stephen Franklin wird Chef des Xenobiologie-Forschungslabors auf der Erde. Sheridan und Delenn ziehen zum neuen Hauptquartier der Interstellaren Allianz nach Minbar.
Unsere Geschichte endet im Jahr 2281, zwanzig Jahre nach Sheridans Tod auf Z'ha'dum: Seine Lebensenergie, die ihm einst Lorien gespendet hatte, erlischt und Sheridan stirbt im All bei Coriana 6, dem Schauplatz des Sieges im Schattenkrieg. Lorien kommt und nimmt seine Leiche mit. Delenn, inzwischen Präsidentin der Interstellaren Allianz, bleibt allein zurück. Sie ernennt General Susan Ivanova zur Nachfolgerin Sheridans als Entil'zha. Garibaldi ist noch immer glücklicher Ehemann und Vater auf dem Mars, Dr. Franklin Chefarzt der Xenobiologie auf der Erde. Vir Cotto ist Imperator der Centauri und hat sein Volk nach Londos Tod aus der Finsternis gerettet. Zack Allan ist sein persönlicher Berater. Londo, G'Kar und Lennier sind tot. Babylon 5 wird, da ihre Aufgabe der Friedenssicherung nun von der Allianz übernommen wird und die großen Handelsrouten um die Station herumführen, von der Erdallianz gesprengt. Sie hat ihre Mission allen Kriegen, Krisen und Widernissen zum Trotze doch erfüllt.
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Der AttentäterAuf Präsident Sheridan wird ein Anschlag durchgeführt. Durch die rechtzeitige Warnung durch einen Telepathen entkommt Sheridan. Er trifft eine Entscheidung den Telepathen eine vorübergehende Heimat auf Babylon-5 zu gewähren.
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Am Rande des TodesMollari erleidet einen Infarkt des Hauptherzens und ringt mit dem Tode. Bei dieser Todeserfahrung wird er mit seiner Vergangenheit konfrontiert.
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Die Stimme des UniversumsAm Rande des Territoriums der Drazi wird ein kleines Volk (die Enphili) seit 10 Jahren ständig von Piraten angegriffen und ausgeplündert. Es gelingt ihnen die Ranger um Hilfe zu bitten. Bei dieser Aktion geraten sie beinahe in einen Hinterhalt der Drazi. Mit Hilfe der auf Babylon 5 lebenden Telephathen nutzt Sheridan dieses aber zu seinem Vorteil.
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Einfache LeuteWährend die Station vom Aliens angegriffen wird, versuchen zwei Angehörige der Crew, Mack und Bo, sich durchs Leben zu schlagen und die Station am Laufen zu halten.
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Lektion des SchreckensZwei auszubildende Ranger geraten auf Babylon 5 in einen Bandenkrieg. Aufgrund der zugesagten Autonomie der Ranger sollen diese den Vorfall selber verfolgen. Der angeschlagene Minbari stellt sich dem Kampf mit dem Bandenchef und schlägt diesen.
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Der Herr der BluthundeBester kommt auf die Station mit seinen "Bluthunden", speziell für die Suche nach Telepathen ausgebildeten PSI-Agenten, um entlaufene Telepathen einzufangen speziell aber Byron. Nachdem fast alle gefangen wurden kommt der Captain Lochley auf eine Idee Zeit zu gewinnen. Sie stellt die Gruppe unter Quarantäne, Bester muß abziehen.
Das Geheimnis um ihre Nominierung kommt ans Tageslicht: Sie war 3 Monate mit Sheridan verheiratet.
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Ein sterbendes VolkDr. Franklin beginnt mit der Arbeit an einer Katalogisierung der Krankheiten fremder Völker und stößt dabei auf ein tödliches Geheimnis.
Die Telepathen auf der Station bekommen weiteren Zulauf. Sie werden zunehmend bedroht und tätlich angegriffen. Nachdem ein junger hoffnungsvoller Telepath überfallen und fast zu Tode geprügelt wird greifen einige zum Mittel der Selbstjustiz. Byron wird festgenommen und kann deshalb den Lynchmord an einem Verbrecher nicht verhindern.
In einer Liebesnacht mit Lyta erfahren Byron und seine Freunde die Wahrheit über die Vorlonen und die Erschaffung der Telepathen und beschließen nun ihr Recht einzufordern.
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Der Tag der TotenCaptain Lochley verkauft für eine Nacht einen Teil der Station Babylon 5 um einem fremden Volk einen religiösen Brauch, den "Tag der Toten" zu ermöglichen der nur alle 200 Jahre gefeiert wird.
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Die TelepathenkolonieAngriffe auf Schiffe der Alliierten nehmen zu. Die Angriffe scheinen aber ausschließlich darauf gerichtet zu sein zu zerstören da keine Waren geraubt werden. Die Telepathen auf Babylon 5 haben die Forderung gestellt, einen Heimatplaneten zu erhalten. Byron trat dafür vor den Rat der Völker und versuchte sie zu erpressen. Sheridan hat ihnen daraufhin die Immunität entzogen.
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Die letzte Gefangene Die Probleme auf Babylon 5 spitzen sich zu. Die Telepathen haben sich im Sektor Braun verbarikadiert. Es kommt zu bewaffneten Auseinandersetzungen. Auf Centauri Prime finden G'Kar und Molari die gefangene Narn Na Toth, die ehemalige Adjudantin von G'Kar. Sie wurde in den Gefängnissen vergessen. Molari und G'Kar schmuggeln sie nach Narn.
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Vergeßt Byron nichtBester jagt auf Babylon 5 abtrünnige Telepathen, besonders aber Byron. Die Telepathen haben sich in der Zwischenzeit verbarrikadiert. Als die Spirale der Gewalt zu eskalieren droht schließt Byron mit Sheridan ein Abkommen, was die gerechte Bestrafung der für die Gewalt schuldigen Telepathen und den freien Abzug der Unschuldigen beinhaltet. Bester setzt sich über dieses Abkommen hinweg. Im anschließenden Kampf beschließen Byron und einige Gefolgsleute den Selbstmord.
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Das Buch des G'KarG'Kar kehrt nach Babylon 5 zurück und wird hier wie ein Heiliger verehrt. Als er auf Centauri war hat die Regierung der Narn beschlossen sein Buch zu retten und ein paar Kopien anzufertigen. Es wird zum Bestseller.
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Das Corp der GnadenlosenEin Telepath gerät außer Kontrolle, ermordet einen Zimmergenossen und begibt sich nach Babylon 5. Bester soll ihn wieder einfangen. Auf Babylon 5 geschehen weitere Morde die eigentlich nicht von einem P10-Telepathen ausgehen können. Es zeigt sich die ganze Brutalität des Psi-Corps besonders den "Normalen" gegenüber.
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Meditations on the AbyssLenier tritt in Geheimauftrag auf White Star 27 in die Ausbildungsgruppe ein. Hier sucht er nach Hinweisen auf die Schuldigen für die Anschläge.
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Am Rande des AbgrundsLenier ist immer noch auf der Suche nach Schuldigen für die Angriffe auf Schiffe der Allianz. Er stößt dabei auf Beweise die auf die Centauri als die Schuldigen zielen. Ihm gelingt es Videoaufnahmen von einem Angriff anzufertigen. Lyta ist weiter auf der Suche nach Unterstützern um den Telepathen eine neue Heimat zu geben. Sie schließt mit G'Kar einen Handel.
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Die BlockadeDem Rat werden Beweise vorgelegt die die Schuld der Centauri an den Übergriffen beweisen. Gegen die Republik der Centauri wird eine Blockade verhängt. Die Centauri lassen daher ihre Handelsschiffe von Kriegsschiffen eskortieren. Garibaldi soll verhindern, daß die Schiffe der Allianz und die Centauri direkt aufeinandertreffen und soll die White-Star-Flotte an den Punkt des Bruchs beordern. Infolge seiner Alkoholsucht schlägt dieser Versuch fehl und es kommt zum Krieg. Mollari fliegt wieder nach Centauri Prime und wird dort mit G'Kar festgesetzt.
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Der letzte BefehlDer Krieg zwischen Centauri und allen anderen Staaten der Liga eskaliert. Die Truppen der Centauri sind in ein Verteidigungs- und ein Angriffslager aufgeteilt was der früheren Taktik der Centauri widerspicht. Auf der Suche nach toten Centauri stoßen Dr. Franklin und Lyta auf dem Heimatplaneten der Drasi auf Schattentechnologie aus den Schiffen der Centauri.
Auf dem Weg nach Minbar gerät Delenn in einen Hinterhalt der Centauri Ihr Schiff wird sehr schwer getroffen und treibt manövrierunfähig im Hyperraum.
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Die Bürde des ImperatorsCentauri Prime wird von Truppen der Narn und der Drasi angegriffen Gesteuert von den Drak befiehlt der Regent der Centauri unter einem Vorwand das Verteidigungssystem zu deaktivieren. Londo wird nach dem Tod des Imperators beauftragt die Kapitulation anzubieten und erhält einen Wächter der Drak. Delenn wird von Schiffen der Centauri im Hyperraum gefunden und nach Centauri Prime gebracht.
Nach dem Ende des Krieges beginnt man sich Gedanken über die Hinterlassenschaften der Schatten und der Vorlonen zu machen.
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Augen aus FeuerNach Anschlägen auf das Psi-Corps werden die Geldquellen bis nach Babylon 5 zu Lyta Alexander zurückverfolgt. Bei der Verhaftung offenbart sie einen weiteren Teil ihrer enormen telepathischen Fähigkeiten, nur Sheridan vermag zu widerstehen. In der Zelle schließen Lyta und Garibaldi, der wegen seines Alkoholismus suspendiert wurde, ein Abkommen, daß es Lyta ermöglicht unbemerkt Geld zu waschen und mit G'Kar die Station zu verlassen.
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Wann, wenn nicht jetztVom Mars kommt eine Botschaft die besagt, daß Michael Garibaldi und Lisa ermordet werden sollen. Auf der Station werden die Vorbereitungen getroffen. Auf einem Abschiedsfest für G'Kar und M. Garibaldi wird der Mörder entdeckt und festgenommen. Ein Narn schießt aber auf G'Kar und trifft dabei Lisa. Garibaldi entdeckt, daß der gesamte Vorstand von Edgar Industries, dem Konzern von Lisa, den Mord beschlossen hat und trifft Vobereitungen. G'Kar und Lyta Alexander verlassen Babylon 5.
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Ein letzter Blick zurückSherdidan und Delenn verlassen Babylon 5 und beziehen das neue Hauptquartier der interstellaren Allianz auf Minbar. Dort erwartet sie bereits Mollari. Er überreicht (im Auftrag seiner neuen Herren) dem Paar einen Pokal den ihr Sohn zu seiner Volljährigkeit erhalten soll. In der Zwischenzeit bezieht auch Garibaldi seine neue Position auf dem Mars als Chef von Edgar Industries und tauscht den Vorstand aus.
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Der Weg ins Licht20 Jahre nach Babylon 5, wir schreiben das Jahr 2281. Sheridan spürt, daß sein Leben sehr bald enden wird. Er bittet seine Freunde und Weggefährten ein letztes Mal nach Minbar um Abschied zu feiern. General Ivanova, Imperator Vir Koto, Dr. Stephen Franklin, Garibaldi kommen ohne Zögern.
Sheridan macht sich am Tag nach dem Treffen auf eine Reise an Punkte aus seiner Vergangenheit. Er besucht die stillgelegte Station Babylon 5 und anschließend das Coriana-System in dem die Schatten endgültig besiegt wurden. Zusammen mit Lorien geht er über die letzte Grenze. Babylon 5 wird nach der Stillegung gesprengt.